SEPIC 电容器 C_S 的选择取决于均方根电流。SEPIC 电容器的均方根电流由下式给出：

方程式 58.

SEPIC 电容器必须具有相对于输出功率的较大交流均方根电流额定值。这一特性使得 SEPIC 非常适合电容器均方根电流较小的低功率应用（相对于电容器技术）。SEPIC 电容器的额定电压必须高于最高输入电压。钽电容器是 SMT 的最佳选择，其相对于尺寸而言具有较高的均方根电流额定值。可以使用陶瓷电容器，但由于大电流，低 C 值往往会导致电容器上的电压变化较大，并且高 C 值陶瓷电容器价格昂贵。电解电容器适用于可以满足均方根电流额定值所需尺寸的通孔应用。C_S 和 L1 之间存在能量平衡，可用于确定电容器的值。基本的能量平衡公式为：

方程式 59.

其中

方程式 60.

是 SEPIC 电容器上的纹波电压，而

方程式 61.

是流经电感器 L1 的纹波电流。可以求解能量平衡公式来得出 C_S 的最小值：

方程式 62.