振荡器可以同步到外部时钟 (SYNC IN)，或输出时钟以同步 SYNC 引脚上的其他器件 (SYNC OUT)。为了支持相移时钟来实现多轨交错和多相运行，对于单相、两相、三相或四相运行，内部振荡器可以从 SYNC 引脚相移 0、90、120、180、240 或 270 度。单相或独立器件的 SYNC IN 或 SYNC OUT 功能以及相位可以通过 ADRSEL 引脚上的引脚 Strap 配置电阻分压器来选择，也可以通过多相环路跟随器器件的 MSEL2 引脚与 AGND 之间的电阻器来选择。

在单输出多相堆叠配置中，SYNC 相位偏移与器件计数和相位一起使用 MSEL2 引脚进行编程。多相堆叠中的环路跟随器器件始终配置为 SYNC_IN，而环路控制器器件可通过 ADRSEL 引脚上的电阻分压器配置为自动检测、SYNC_IN 或 SYNC_OUT。

在初始上电和引脚检测之后，如果 SYNC IN/OUT 设置为自动检测配置，TPS546A24S 会检测 SYNC 引脚，以确定是否存在任何外部 SYNC 时钟。SYNC 引脚上的开关操作或一致上拉会将器件设置为 SYNC_IN，而 SYNC 上的一致下拉会将器件设置为 SYNC_OUT。编程为环路跟随器的 TPS546A24S 器件始终编程为同步输入。

当配置为 SYNC_IN 时，如果 SYNC 输入脉冲在两个周期内丢失，或者振荡器频率降至自由运行开关频率的 50% 以下，则器件将确定 SYNC 时钟丢失。如果 TPS546A24S 是多相堆叠的一部分，则转换器会关断并保持禁用状态，直到重新建立 SYNC 信号，以防止由于同步丢失而造成损坏。单相独立器件继续以标称频率的大概 70% 运行。